どうやら、クラスのすべてをインスタンス化した画像(png)が提供されているわけではないようです。
ですが、jsonファイルには、フラグメントの状態で、各クラスが保存されている(1本の電柱がオクルージョンのせいで2つになっている)ので、とりあえず、それをインスタンスとしてcocoフォーマットで保存して扱うという、やむを得ない方法をとることはできる。
cityscapesを利用した教師データはcityscapesScriptsを使うといろいろできそう。

How to generate Training Data for instance segmentation, Mask R-CNN,from Citsscapes Dataset using cityscapesscripts

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